بهینه سازی روش استخراج RNA از گیاه فندق

مونا رئیس پورشیرازی¹ سارا السادات راهپیما² سجاد رشیدی منفرد³ جعفر ذوالعلی⁴

1) دانشجوی مقطع کارشناسی ارشد گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر
2) استادیار گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان,ایران-
3) استادیار گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی،دانشگاه تربیت مدرس
4) استادیار گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان,ایران-

محل انتشار : سومین کنفرانس بین المللی توسعه پایدار، راهکارها و چالش ها با محوریت کشاورزی ، منابع طبیعی، محیط زیست و گردشگری(3icsda.ir)
چکیده :
فندق از خانواده Betulaceae بانام علمی Corylus avellana و یکی از مهم‌ترین محصولات آجیلی در جهان است و به خاطر داشتن اسیدهای چرب ضروری، استرول‌ها ، آنتی‌اکسیدان‌ها حائز اهمیت می‌باشد.قسمت‌های مختلف این گیاه حاوی انواع مهمی از متابولیت های دارویی با اثرات ضد سرطانی و ضد میکروبی ارزشمند نظیر تاکسول می‌باشد.تاکسول یک دی ترپنوئید است که اولین بار از درخت سرخدار و سپس از درختان دیگر مانند فندق جداسازی شد.برخلاف اثرات دارویی این گیاه ترکیبات فنولی ومتابولیت های ثانویه دیگری به‌عنوان مشکل اصلی در استخراج RNA مناسب برای تجزیه‌وتحلیل بیان ژن و مهندسی ژنتیک محسوب می‌شوند. هدف از انجام این آزمایش ، مقایسه روش‌های مختلف استخراج RNA از کالوس فندق بود. ازاین‌رو هفت دستورالعمل شامل دو روش دستی و پنج کیت تجاری ازنظر کمیت و کیفت RNA استخراج‌شده ، ارزیابی و مقایسه شدند.به‌منظور ارزیابی از اسپکتروفتومتری ، الکتروفورز ژل آگارز و واکنش RT-PCR استفاده شد.از بین روش‌های موردمطالعه ، کمیت و کیفیت RNAی استخراج‌شده با روش SDS و کیت Total RNA isolation نسبت به روش‌های دیگر مناسب‌تر بود. از محاسن این روش‌ها کوتاه بودن زمان استخراج و کم‌هزینه‌تر بودن آن‌ها است. ساخت cDNA با استفاده از RNAهای استخراج‌شده از طریق این دو روش با موفقیت انجام و واکنش RT-PCR باندهای مورد انتظار را تولید نمود. بنابراین به نظر می‌رسد این روش‌ها برای استخراج RNA مناسب باشد.
کلمات کلیدی : واژه‌هاي كليدي: استخراج RNA فندق ترکیبات فنولی الکتروفورز اسپکتروفتومتری