آنالیز بیان افتراقی ژن‌های بافت جنین زنبورعسل نر و ماده در ساعات پس از تخم‌گذاری با استفاده از داده‌های ترانسکریپتومیکس

میلاد غلامی‌ طاحونه¹ مهدی فرضی² حسین مرادی‌ شهربابک³

1) فارغ التحصيل کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام وطیور، گروه علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.
2) فارغ التحصيل کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام وطیور، گروه علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.
3) استادیار، گروه علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.

محل انتشار : دومین همایش ملی و اولین همایش بین‌المللی پرورش زنبور عسل(iranapiculture.ir)
چکیده :
در پژوهش حاضر با هدف مطالعه پروفایل بیان ژن و تعیین ژن‌های شاخص با بیان متفاوت و معنی‎دار بین دو گروه جنین زنبورعسل نر و ماده در سه زیرگروه ساعات پس از تخم‌گذاری (10الی15ساعت، 25الی40ساعت و 55الی70ساعت پس از تخم‌گذاری) پس از اخذ و ذخیره داده‌های خام، مراحل آنالیز به ترتیب با استفاده از نرم‌افزارهای Fastq-dump، FastQC و Trimmomatic، Hisat2، Samtools و Cufflinks انجام شده و در نهایت آنالیز هستی‌شناسی به وسیله پایگاه‌های اطلاعاتی DAVID و Ensemble صورت گرفت. طبق نتایج پروفایل بیان ژن، 17786 شناسه ژن مشخص شد، که در نهایت با در نظر گرفتن log2(fold_change)>+4 و log2(fold_change)<-4، در گروه های 10الی15، 25الی40 و 55الی70ساعت پس از تخم‌گذاری به ترتیب، چهار، 26 و یک ژن شاخص با بیان متفاوت و معنی‌دار شناسایی شد (q_value<0.05). نتایج آنالیز هستی‌شناسی ژن‌های شاخص نشان داد که در اتصال DNA، متابولیسم اسیدآمینه و کربوهیدرات، بیوسنتز هورمون حشرات و اتصال یون‌های کلسیم، روی و آهن نقش دارند.
کلمات کلیدی : آنالیز هستی‌شناسی ژن بیان افتراقی ژن ترانسکریپتوم زنبورعسل ژن شاخص