تاثیر نگاشت ها و پنجره های مختلف جهت تعیین محل نواحی کد کننده ی پروتئین در توالی DNA

منصوره دهنوی¹ موسی شمسی² علی فهمی جعفرقلخانلو³ سولماز دولتی⁴

1) دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشکده مهندسی پزشکی، دانشگاه صنعتی سهند، تبریز، ایران،
2) استاد، دانشکده مهندسی پزشکی، دانشگاه صنعتی سهند، تبریز، ایران،
3) دانشجوی دکتری، دانشکده مهندسی پزشکی، دانشگاه صنعتی سهند، تبریز، ایران،
4) دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشکده مهندسی پزشکی، دانشگاه صنعتی سهند، تبریز، ایران،

کد IOI مقاله : XDCZ-FZDAZ
محل انتشار : اولین کنفرانس مهندسی و فن آوری دانشگاه تبریز(ncoei.ir)
چکیده :
    بیوانفورماتیک، طراحی سیستم¬های کامپیوتری و مدل¬های ریاضی برای نگهداری، مدیریت و تجزیه و تحلیل مجموعه عظیمی از داده¬های بیولوژیکی مانند DNA ، RNAو پروتئین را شامل می¬شود. هدف اصلی علم ژنتیک، درك ماهیت اطلاعات نهفته در ژن¬ها و نقش آن¬ها در تعیین عملکردهای خاصی است که توسط ژن¬ها بیان می¬شود. یکی از گام¬های اصلی برای رسیدن به این هدف، شناسایی ماهیت و موقعیت بخش¬های مختلف در رشته¬هایDNA ، از جمله نواحی کدکننده پروتئین است. تعیین نواحی کدکننده پروتئین در توالی DNA، به عنوان یکی از چالش برانگیزترین موضوعات تحقیق در زمینه بیوانفورماتیک مطرح بوده است. در این پژوهش با به‌کارگیری روش های نگاشت متفاوت و پنجره های متفاوت و اعمال الگوریتم گورتزل بر روی داده¬های سیگنالی DNA به تعیین محل نواحی کدکننده پروتئین)اگزون-ها) پرداخته و تاثیر نگاشت¬ها و پنجره¬های مختلف را در تعیین محل نواحی کدکننده پروتئین بررسی کرده¬ایم. براساس نتایج به¬دست¬آمده به این نتیجه رسیدیم که الگوریتم پیشنهادی دارای بالاترین مقادیر سطح زیر منحنی، دقت، ویژگی، حساسیت و همبستگی تقریبی هستند و از بین انواع نگاشت و پنجره¬ها، نگاشت EIIP و پنجره Kaiser55 بهترین عمل¬کرد را دارند.

کلمات کلیدی : پردازش سیگنال دیجیتال نواحی کد کننده¬ی پروتئین روش¬های پنجره¬گذاری نگاشت¬ها در توالی dna