شناسايي مكانيزم تعامل lncRNA-miRNA-mRNA در سرطان پستان بر اساس تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي

سعید زارع¹

1) سعید زارع

کد IOI مقاله : XEBZ-GGEGA
محل انتشار : چهارمین همایش ملی زیست شناسی (bioconf.ir)
چکیده :
    RNA هاي غير كدشونده نقش مهمي در تنظيم بيان ژن هاي خاص دارند و در فرايندهاي بيولوژيكي سرطان پستان دخيل هستند. اكثريت مطالعات بر تعريف فعاليت هاي تنظيمي RNA هاي غير كدشونده طولاني (lncRNAs) و miRs / miRNAs) microRNAs) متمركز شده اند و مطالعات اندكي در باره چگونگي رونويسي چگونه lncRNAs و miRNAs انجام شده است. در مطالعه حاضر، بر اساس مجموعه داده هاي كارسينوم مهاجم پستان از Atlas Genome Cancer در cBioPortal و با استفاده از رويكرد محاسباتي بيوانفورماتيك، يك شبكه mRNA-miRNA-lRNA ساخته شد. اين شبكه شامل 601 گره و 706 لبه بود كه نشان دهنده شبكه پيچيده اي از اثرات تنظيمي بين miRNAs ،lncRNAs و ژن هاي هدف است. نتايج اين مطالعه نشان داد كه 510-miR قويترين گيرنده و تنظيم كننده miRNA تعداد زيادي ژن هدف است. علاوه بر اين، مشاهده شد كه CCAT1 ،lncRNAs PVT1 و linc00861 تعامل هاي احتمالي با بيوماركرهاي باليني، شامل پروتئين گيرنده تيروزيين پروتئين 2-kinase erbB، گيرنده استروژن و گيرنده پروژسترون اثبات شده با استفاده از نرم افزار پيش بيني ارتباط متقابل پروتئين- RNAرا نشان داد، شبكه تعامل mRNA-miRNA-lncRNA مطالعات تجربي بيشتري را تسهيل مي كند و ممكن است براي تسهيل پيش بيني هاي biomarker براي توسعه روش هاي درمان جديد در سرطان پستان استفاده شود.

کلمات کلیدی : سرطان پستان rna های طولانی غیر کد شونده میکرو آرنا بیوانفورماتیک mrna