تعیین توالی، آنالیزهای بیوانفورماتیکی و بررسی موتیف های قسمتی از پروموتور ژن بتاکازئین در شترهای دو کوهان ایران

مجتبی طهمورث پور¹ الیاس محمدی² نغمه ساعدی³

1) استاد تمام و عضو هیئت علمی دانشگاه فردوسی مشهد
2) کارشناس ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام ، دانشگاه فردوسی مشهد
3) کارشناس ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام ، دانشگاه فردوسی مشهد

کد IOI مقاله : XYAA-ZBBHK
محل انتشار : دومین کنفرانس بین المللی توسعه پایدار، راهکارها و چالش ها با محوریت کشاورزی ، منابع طبیعی، محیط زیست و گردشگری(2icsda.ir)
چکیده :
    هدف ما از این مطالعه توالی یابی، آنالیز بیوانفورماتیکی و بررسی موتیف های قسمتی از پروموتور ژن بتا کازئین در شتر های دو کوهان ایران و همچنین بررسی تفاوت های تک نوکلئوتیدی (SNPs) ممکن این توالی در گونه شتر دو کوهان ایران بود.تعداد 5 عدد نمونه خون شتر نر و ماده دو کوهان از ایستگاه تحقیقات منابع طبیعی و امور دام استان اردبیل واقع در روستای جهاد آباد تهیه گردید. پس از عمل استخراج DNA واکنش PCR برای هریک از نمونه ها توسط پرایمرهای اختصاصی انجام شد و عمل توالی یابی با استفاده از محصولات PCR انجام شد. توالی های مورد توافق برای شترهای دو کوهانه بدست آمد. با استفاده از همین توالی مورد توافق بررسی موتیف ها، بررسی های فیلوژنتیکی و سایر بررسی ها انجام شد. بر اساس مقایسه توالی های بدست آمده در این مطالعه با توالی ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی NCBI مشخص شد که توالی قسمتی از پروموتور ژن بتا کازئین، با توجه به وجود هاپلوتایپ های متفاوت جهشی را نشان نمی دهد. توالی یابی 5 نمونه مختلف پروموتور ژن بتا کازئین از شتر دو کوهان به ما این اجازه را داد که تعدادی تفاوت هاپلوتایپی را در این ژن ها شناسایی کنیم. بررسی ها پنج نوع هاپلوتایپ را در شتر های دو کوهان نشان داد.

کلمات کلیدی : بررسی توالی و ساختار تفاوت های تک نوکلئوتیدی پروموتور ژن بتا کازئین شتر دو کوهانه