شناسایی مکانیسم microRNA-10bدر سرطان دهان

یوسف آریان مهر¹ سولماز علی حسینی² مونا پیمان³ حکیمه زالی⁴ سعید حسامی⁵

1) دانشجوی دانشگاه آزاد اسلامی تهران مرکز
2) دانشجوی دانشگاه آزاد اسلامی تهران مرکز
3) دانشجوی دانشگاه آزاد اسلامی تهران مرکز
4) عضو هیئت علمی دانشگاه شهید بهشتی دانشکده فن آوریهای نوین مرکز نانو تکنولوژی و مهندسی بافت
5) عضو هیئت دانشگاه آزاد تهران مرکز گروه زیست شناسی

محل انتشار : کنفرانس بین المللی پژوهش در مهندسی، علوم و تکنولوژِی(restconf.org)
چکیده :
میکروRNAها گروهی از RNAهای غیر کننده هستند که بیان ژنهای هدف را بصورت منفی در سطح پس از رونویسی تنظیم می کنند .میکروRNAها انواع مختلفی از فرایندهای سلولی مانند تکثیر, تمایز, متابولیسم ,کهولت و مرگ سلولی را تنظیم می کنند .در صورت تنظیم نبودن این مولکولهای کوچک باعث ایجاد برخی بیماریها از جمله سرطان می گردد بافتهای انسانی و مایعات بدن انسان منبع غنی از زیست نشانگرها می باشد که از انها در تشخیص های بالینی بکار گرفته می شود اخیرا هم گزارش شده که بافتها و مایعات بدن دارای میکروRNA کافی پایدار می باشد که از انها به عنوان نشانگرهای غیر تهاجمی برای تشخیص و پیش اگهی می توان استفاده کرد .(Iorio & Croce, 2012) در این مطالعه میکرو RNA-10b و ارتباط این ریز RNA در سرطان دهان و مکانیسم ان را با کمک الگوریتم GeneTrail2 و دیتا بیس Transcriptomics وارتباط ژنهای دخیل در سرطان دهان که از دیتا بیس GeneCard بدست امده است تعیین شد .میکرو RNA-10b با توجه به مطالعات گذشته دارای بیان بالا در سرطان دهان می باشد که با کمک آنالیز qPCR بدست آمده است علاوه بر این عملکرد بیولوژیکی این مولکول کوچک بعد از تغییر بیان مورد بررسی قرار گرفته که در ان کاهش میکرو RNA-10b به وسیله الیگونوکلئوتید آنتی سنس باعث به تاخیر انداختن مهاجرت سلولی و توانایی تمایز می شود با این حال تغییرات معنی داری نسبت به رشد سلول و حساسیت به شیمی دارویی نشان نمی دهد .(Lu & Cheng, 2011) از مسیر KEGG-Pathway مسیرهای با بیشترین ژن دخیل انتخاب شد و از طریق نرم افزار Gene List venn diagram اشتراک ژنهای این مسیرها را در دیتا بیس STITCH4 برای بدست اوردن داروهای موثر بر بیماریها بدست امد و با استفاده از Drugbank مکانیسم و عملکرد این داروها را بدست امد .(Lu et al., 2012) STITCH یک منبع برای کشف شناخته ها و پیش بینی تعاملات شیمیایی پروتئینها می باشد . مواد شیمیایی با هم در ارتباط هستند و پروتئینها که به کمک آزمایش ,دیتا بیس تایید شده است.STITCH شامل واکنش بیش از 300000مولکول کوچک و بیش از 2.6میلیون پروتئین از 1133 ارگانیسم می باشد .(Silva, 2013)
کلمات کلیدی : سرطان دهان ,میکروRNA ,میکروRNA-10b