تعیین مکانسیم اتصال ترویج لومفلوکساسین در بر همکنش با هالوترانسفرین توسط روشهای مدلینگ مولکولی

تعیین مکانسیم اتصال ترویج لومفلوکساسین در بر همکنش با هالوترانسفرین توسط روشهای مدلینگ مولکولی

سمیه معروضی1

1) کارشناسی ارشد بیوفیزیک , دانشگاه آزاد اسلامی واحد مشهد , ایران -

کد IOI مقاله : XYBB-ZHDKF
محل انتشار : سومین کنفرانس بین المللی پژوهش در علوم و تکنولوژی(3rstconf.com)
چکیده :
    هالوترانسفرین یکی از پروتئین های مونومریک از خانواده ترانسفرین سرم است , که دارای یک زنجیره گلیکوپروتئینی با 679 اسید امینه داخلی که حاوی پروتئینی دو زنجیره می باشد , هر زنجیره 3 تریپتوفان دارد.ساختار داخلی ترانسفرین انسانی در از PDB دریافت کردیم.خروجی آن بصورت (1BTJ) برای هالوترانسفرین از بانک اطلاعات پروتئین RCSB است. درک کامل ساختار اصلی در توانایی تخمین مجموعه پروتئین - لیگاند, درستی و سرعت پروتکل اتصال و توانایی متصور ساختن هندسه اتصال و برهمکنش الزامی است. بنابراین ما مطالعه برهمکنش هالوترانسفرین و لومفلوکساسین با نرم افزار اتوداک و تئوری تابع چگالی انجام دادیم. تئوری داکینگ روند اتصال لومفلوکساسین به مولکولها اینگونه نشان می دهد: Trp264 (B) > Trp128 (A) Tyr71(B) > Tyr45 (A) > Tyr223 (A) > Tyr 314 (A) > Tyr 136 (A) > Tyr 185 (B) > Tyr 238 (B)

کلمات کلیدی : هالوترانسفرین لومفلوکساسین داکینگ هالوترانسفرین/ لومفلوکساسین تئوری تابع چگالی