Lomefloxacin promotes the interaction between holo transferrin in the determination of the binding mechanism by Molecular modeling technique

Somayeh Marouzi¹

Abstract :
Human holo Transfrrin (HTF) is one of the monomeric serum proteins of family Tf that consist of a single_chain glycoprotein with 679 amino acid residu That protein containing two chains, each chain has three Trp residues. The crystal structure of human transferrin in complex with its receptor was retrieved from PDB. Out of the entries (1BTJ) for HTF from RCSB protein data bank (http://www.rcsb. org/pdb).A thorough understanding of the structural principles that estimating the strength of a protein-ligand complex, an accurate and fast docking protocol and the ability to visualize binding geometries and interactions are mandatory. Thus we study the interactions of HTF and Lamefloxacin by means of autodock and density functional theory (DFT). The docked pose of these molecules showed that following trends Affinity to LMF : Trp264 (B) > Trp128 (A) Tyr71(B) > Tyr45 (A) > Tyr223 (A) > Tyr 314 (A) > Tyr 136 (A) > Tyr 185 (B) > Tyr 238 (B)

Keywords : holo transferrin lomefloxacin htf/lmf docking density functional theory (dft)

---

زبان مقاله : انگلیسی
محور مقاله : علوم زیسـتی
محل انتشار : سومین کنفرانس بین المللی پژوهش در علوم و تکنولوژی
آدرس وب سایت کنفرانس : 3rstconf.com
کد IOI مقاله : XYBB-ZHDKF
لینک مستقیم مقاله : https://isnac.ir/XYBB-ZHDKF
نمایش چکیده فارسی : https://isnac.ir/SA/XYBB-ZHDKF

سایر مقالات ارائه دهنده

1. Lomefloxacin promotes the interaction between holo transferrin in the determination of the binding mechanism by Molecular modeling technique

سایر مقالات محل انتشار

1. The effective indices in designing nature pattern in the handicrafts
2. بررسی تاثیر امواج مایکروویو با توان¬ها و زمان¬های مختلف روی تخم، شفیره و حشره کامل سوسک چهارنقطه¬ای حبوبات Callosobruchus maculatus (Col,. Bruchidae)
3. بررسی اختلاف فازبین جریانات جزرومدی ونوسانات سطح آب دررودخانه کارون واقع در خرمشهر
4. آسیب های شبکه های اجتماعی در محیط کار و خانواده
5. تشخیص سرطان ریه از طریق تکنیک‌های داده‌کاوی تصویری،مقاله مروری
6. تهويه و تبريد طبيعي با بهره گيري از ارزشهاي معماري سنتي ايران
7. Study of Sinusoidal PWM Technique and improved converter matrix for Direct torque control (DTC) of induction motor
8. تاثیر کالبد صنعتی و عواقب آن در کاهش سلامت روان
9. بررسی تکتونیک فعال با استفاده از شاخص¬های مورفوتکتونیک كوهستاني در شمال وشمال غرب ازنا(استان لرستان)
10. برررسی حمله انکار سرویس(DOS) درشبکه خودرویی VANET و ارائه راه حل
11. Check problematic factors in the process of Azar oilfield drilling
12. اثر باکتری اشریشیا کلی بر روی افزایش حساسیت خانواده انتروباکتریاسه در پاسخ به آنتی بیوتیک خانواده های آمینوگلیکوزید ها و...
13. Assessment of heavy metals (Cd -Pb) in three wetland sediments Gavkhooni 91-85 years
14. A Comparison between Ultrasonic Machining and Traditional Machining on Inconel 718 to Assess the Parameters Including Surface Roughness, Tool Wear, and the Cutting Force
15. مقایسه تحلیلی عدالت درفلسفه سیاسی افلاطون و جان راولز (باتاکیدبرنظریه مثال خیرافلاطون)